UNIVERS DES ETUDIANTS EN LICENCE 1 DE L\'ISAD

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cours de dr Atta

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                 Comparaison des séquences d’acides aminés des globines alpha 

 

 

Comparaison des séquences d’acides aminés (données extraites du logiciel ‘’Evolmol’’)

 

 

séquences d’acides aminés  de la globine a de 7 « espèces »

(traitement/logiciel avec globine a humaine comme référence)

Homme

VLSPADKTNV

KAAWGKVGAH

AGEYGAEALE

RMFLSFPTTK

TYFPHFDLSH

GSAQVKGHG

Chimpanzé

VLSPADKTNV

KAAWGKVGAH

AGEYGAEALE

RMFLSFPTTK

TYFPHFDLSH

GSAQVKGHG

Gorille

VLSPADKTNV

KAAWGKVGAH

AGDYGAEALE

RMFLSFPTTK

TYFPHFDLSH

GSAQVKGHG

Orang Outang

VLSPADKTNV

KTAWGKVGAH

AGDYGAEALE

RMFLSFPTTK

TYFPHFDLSH

GSAQVKDHG

Macaque Rh.

VLSPADKSNV

KAAWGKVGGH

AGEYGAEALE

RMFLSFPTTK

TYFPHFDLSH

GSAQVKGHG

Tarsier de Bor.

VLSPADKTNV

KAAWDKVGGH

AGDYGAEALE

RMFLSFPTTK

TYFPHFDLSH

GSSQVKGHG

Chien

VLSPADKTNI

KSTWDKIGGH

AGDYGGEALD

RTFQSFPTTK

TYFPHFDLSP

GSAQVKAHG

Une protéine est une séquence ordonnée d’acides aminés (ordre déterminé par un gène) chaque lettre désigne conventionnellement un acide aminé

 

matrice des distances

% des différences (nb diff.X100/141) entre les séquences de globine a (tableau précédent)

plus les différences sont faibles plus l’ancêtre commun à 2 espèces est  proche (temps)

 

Homme

Chimpanzé

Gorille

Macaque Rh.

Orang Outang

Tarsier de B

Chien

Homme

0

 

 

 

 

 

 

Chimpanzé

0

0

 

 

 

 

 

Gorille

0.71

0.71

0

 

 

 

 

Macaque Rh.

2.84

2.84

3.55

0

 

 

 

Orang Outang

2.13

2.13

1.42

4.96

0

 

 

Tarsier de B

8.51

8.51

7.80

7.80

9.22

0

 

Chien

16.31

16.31

15.60

17.02

15.60

14.89

0

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 



05/04/2013
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